Kaptan köşkünde mürettebatı rehin alan teröristin idaresindeki, gemi Marmara Denizi'nde daireler çizdikten sonra yakıtı bitince İstanbul Silivri açıklarında demirledi. Güvenlik güçlerinin tesyim olması konusunda yapılan uyarılar terörist tarafından dikkate alınmadı. Bunun üzerine saat 05.35'de tüm güvenlik birimlerinin düzenlediği ortak operasyonda terörist ölü olarak gele geçirilirken yolcu ve mürettebat da sağ olarak kurtarıldı.
Olay yerinde basın açıklaması yapan İstanbul Valisi Hüseyin Avni Mutlu, Kocaeli Büyükşehir Belediyesi'ne ait Kartepe isimli Deniz Otobüsünü kaçıran ve 1 kişi olduğunu belirtiği teröristin ölü olarak ele geçirildiğini söyledi. Vali Mutlu operasyon aşaması ile ilgili şu bilgileri verdi:
"Kocaeli Büyükşehir Belediyesi'ne ait Kartepe isimli deniz otobüsünün bir eylemci tarafından kaçırılmas ile ilgili olarak bügün sabah saat 05.35'te güvenlik birimlerimizin ortak operasyonuyla, başarılı bir operasyon yapılmış ve eylemci ölü olarak ele geçirilmiştir. Bu eylemle ilgili olarak İstanbul deniz liman sahasında kaçırılan deniz aracının girdiği andan itibaren bütün ilgili birimlerimiz güvenlik teşkilatlarımız ciddi bir koordinasyon içzerisinde geminin harekini takip etmiş ve eylemci ile ilgili olarak, sayısı, kimliği, gerçekleştirmek istediği eylemin yöntemi, bomba düzeni ile ilgili olarak çok yoğun bir araştırma ve koordinasyon yürütmüştür. Valilik Kriz Merkezinde tüm bilgiler titizlikle incelenmiş ve eylemcinin teslim olması noktasında beklentiler sürdürülürken, yapılacak çalışmalar da çok dikkatli bir şekilde hazırlamıştır.
Silivri açıklarında geminin demirlediği andan itibarın operasyon çevçevesinde saat 05.35 itibarı ile bu operasyonun gerçekleştirilmesi için karar verilmiş ve çok kısa bir süre sonra gemiye çıkılarak eylemci ölü olarak ele geçirilmiştir. Yolcular ve mürettebatla ilgili en ufak bir problem yoktur. Adli makamlar bilgilendirilmiş ve onlarında bu noktadan sonra yapılacak işlemler koordineli şekilde takip edilecektir.
Şahsin kimlik bilgilerinin tesbitini sürdürüyoruz ancak zaman zaman alınan bilgilerle ilgili kimliğine yönelik bilgilerde farklı kimliklere ulaştık. Eylemcinin üzerinde bir düzenek mevcuttur. Kablolar, tertibat vardır. Ancak uzmanların yapacağı inceleme sonucu nasıl bir düzenek olduğu anlaşılacaktır. Çatışma operasyonu gerçekleştiren ortak bir operasyon düzenlenmiştir. Tüm güvenlikle ilgili birimlerimiz görev almıştır.